La seua presència incontrolada pot causar greus molèsties a la fauna en procés de reproducció i als nombrosos grups d’estudiants que visiten el paratge
El Consorci riu Millars gestionat pels ajuntaments de Borriana, Almassora, Vila-real, la Diputació de Castelló i la Generalitat Valenciana adverteix de la prohibició de passejar gossos sense nugar per l’interior del Paisatge Protegit de la Desembocadura. Durant els últims anys ha augmentat el nombre de propietaris de gossos que trien les diferents rutes que hi ha al Paisatge Protegit de la Desembocadura del riu Millars per a eixir a passejar amb la mascota. La ruta botànica, la ruta de l’aigua, la ruta verda, les llacunes artificials i la platja de les Goles són freqüentades cada dia per desenes de caminants, esportistes, escolars, ornitòlegs i altres visitants que a vegades s’han trobat de cara amb gossos solts, alguns d’ells de races perilloses. Recentment un grup d’estudiants d’un centre educatiu de Castelló que estava en la zona de les revalladores per a conéixer algunes infraestructures hidràuliques com la Casa de les Reixes d’Almassora i l’assut de Borriana es van trobar amb dos gossos de races perilloses que transitaven sols i a bastant distància dels seus amos. Els animals van causar un esglai important entre els estudiants. Els propietaris que els duien solts van ser advertits a posteriori per la Guarderia rural del Consorci. També a hores d’ara hi ha centenars d’aus que han iniciat el període de la reproducció. Algunes d’elles fabriquen els nius a la vora dels camins habilitats per a les persones i per tant la presència de gossos solts que transiten lliurement pel paratge pot provocar greus danys en l’èxit reproductiu de les aus. La Llei d’Espais Naturals Protegits de la Comunitat Valenciana i la Llei de Patrimoni Natural i de la Biodiversitat del Govern d’Espanya arrepleguen en els seus articles l’obligació de respectar la fauna salvatge que habita als espais protegits. El Paisatge Protegit de la Desembocadura del riu Millars està protegit des de l’any 2012. Com altres espais naturals valencians de gran importància ecològica disposa de diverses zones especialment sensibles per a la fauna salvatge i la flora silvestre. La presència de gossos al paratge en aquells llocs destinats a la pràctica del senderisme o al passeig està permesa sempre que els propietaris tinguen cura de dur-los nugats o ben controlats en tot moment, és a dir, a menys de 2 metres de distància. La Guarderia rural del Consorci és molt estricta en el compliment d’aquesta mesura especialment durant l’època de la reproducció de les aus, és a dir, des del mes març fins al setembre. Els gossos han d’anar nugats per a evitar que penetren en la làmina d’aigua del riu, a les llacunes artificials, que regiren entre la vegetació o que puguen molestar les xiquetes i els xiquets que visiten diàriament el paratge. La guarderia rural del Consorci riu Millars informa diàriament a desenes d’usuaris del Paisatge Protegit de la Desembocadura de la necessitat de dur els gossos nugats pels llocs més sensibles del paisatge protegit.